头索动物：文昌鱼
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文昌鱼有哈氏凹窝（英语：Hatschek's pit）（Hatschek's pit），具有类似脑下腺的结构，能产生类似脊椎动物促性腺激素的物质，并具备原始的激素调控作用。
尾索动物：海鞘
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海鞘有神经腺（Neural gland），是一个囊状构造，位于神经节下方，以纤毛漏斗开口于咽部的背方。含有升压素和类似催产素的物质，但其功能仍有待研究，该腺体与文昌鱼的哈氏凹窝相似。在咽部有一个类似甲状腺的分泌糖蛋白的内分泌腺，该腺体的分泌受血液运送的某物质所控制。
圆口纲：八目鳗
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松果眼影响八目鳗的沙床幼虫随昼夜的体色变化、变态及生殖作用。
脑垂腺会分泌黑素胞刺激素、精胺酸血管加压素、生殖促进素。黑素胞刺激素的分泌是由松果眼经由下视丘来控制，可影响体色的变化。八目鳗的脑垂腺具有其它脊椎动物的主要特点，但缺乏足额的激素，控制系统较简单。
没有肾上腺，只有肾上腺组织，分散在身体各部分，有两类细胞。肾间细胞（interrenal cell）在前肾一带大静脉的下方形成若干簇。肾上组织（suprarenal tissue）很发达，分布在心脏和大型血管壁上，含有儿茶酚胺，心脏组织中有肾上腺素和正肾上腺素。
在前肠和肠的交接处，有成簇的兰氏滤泡（follicles of Langerhans），其中只发现一种与哺乳动物分泌胰岛素相似的β细胞。若用烧灼法破坏此组织，会引起血糖增高；若注射葡萄糖则这些细胞内会形成液泡，故这些细胞与糖类代谢有关。